海昌是我国新兴沿海城市，也是境外间谍组织关注的重点，随着国安局一名侦查员的意外失踪，拉开了一场反谍大战，李厅长（巫刚 饰）责成武梅（刘佳 饰）构成专案组进行调查。一艘渔船在我“摸索一号”科考船邻近意外打捞起一只奇形怪状的“水母”，深海研究院的总工程师岳诚（李进荣 饰）率众专家对其展开了攻关。境外间谍头子彼得森命令海昌埋伏特务王维韬（王志文 饰）不惜一切代价夺回隐蔽在“水母”中的核心机密。经过一番斗智斗勇，狡猾的王维韬最终落入法网，但武梅却发现了隐蔽在表面案伴背后更大的阴谋，敌人已将多枚水母投放到我国海域，以窃取我海洋信息，武梅熟悉到，更大的对手即将出现......