在一个阳光明媚的日子里，草帽海贼团的伙伴们正在某个海滩安闲度假。然而泊在岸边黄金梅利号就在他们鼻子底下被人偷走。一个礼拜后，他们仍然灰溜溜地在海上流浪。正在为难之时，路修等人遇见小毛贼博洛德和阿基斯。这二人正打算前去发条岛窃取宝贵的钻石钟，而黄金梅利号很可能就是占据岛上的扑克牌海贼团所窃。不久他们遇见扑克牌海贼团的船队，然初次交手便告失利，娜美更被对方虏去。为了找回船和同伴，并获得钻石钟，草帽海贼团与盗贼兄弟燃气斗志，向发条岛挺进…… 　　本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2001年上映的第二部动画剧场版，尾田同时担负作画监视。